Если у Вас сотрудник заболел в отпуске, вне зависимости от кода листка нетрудоспособности это является основанием для продления отпуска на количество дней, совпавших с ежегодным оплачиваемым отпуском.
Обоснование вывода: часть 1 ст.124 ТК РФ.
По желанию работника отпуск, прерванный больничным, либо продлевается на неотгулянные дни, либо переносится на другой период.