Если данные в разделе 3 не меняются, то в уточненный расчет этот раздел включать не надо.
В вашем уточненном расчете раздел 3 полностью повторяет раздел 3 первичного расчета? Отказ в приеме расчета за полугодие приходит из налоговой или ошибка появляется при проверке расчета в программе оператора ЭДО?