Добрый день.
При аренде муниципального имущества у органа власти арендатор является налоговым агентом. В качастве агента он должен удержать из арендной платы НДС, перечислить удержанный налог в бюджет и представить декларацию по НДС. Система налогообложения арендатора значения не имеет