Если фнс освободит ИП от уплаты НДС в связи с недостаточным объемом доходов, то этот НДС не будет...

Мой первый вопрос вам был: собираетесь ли вы оставаться на ПСН или хотите перейти на ОСНО. Вы ответили, что хотите остаться на ПСН и просто выписывать счета-фактуры одному контрагенту (у вас вообще есть другие клиенты, кроме него?) Я вам написала, что делать в этом случае. Или вы все-таки хотите перейти на ОСНО? Тут есть свои заморочки.

Находясь на ПСН, вы не можете получить никакое освобождени еот НДС, так как в принципе не являетесь его плательщиком. Если вы перейдете на ОСНО, то тут разговор другой. Но этот другой разговор так же бессмысленный, так как если вы получите освобождение от НДС, то станете так же неинтересны своему контрагенту, так как по вашим услугам ему нечего будет принять к вычету.

Выхода у вас два:

1. Вежливо послать вашего контрагента с его хотелками.

2. Платить НДС, сдавать электронно отчетность и выписывать счета-фактуры контрагенту. А уж на какой системе налогообложения это делать - надо считать. Но ОСНО по сравнению с ПСН - много головной боли в виде отчетов и уплат налогов.