На самом деле, я спрашивала про две разные ситуации. С первой мне понятно, рассчитали авансовые...
Если не хотите, чтобы ваши 3000 рублей болтались на счету, можете написать заявление на зачет этой суммы по другому налогу или на возврат на расчетный счет. Тогда в декларации за следующий налоговый период никакой путаницы не будет.
Надеюсь, теперь правильно поняла ваш вопрос.
В декларации за 2018 год вам сумму переплаты по УСН, которая образовалась по итогам 2017 года отражать не надо. Вы просто заполняете новыми данными и все. Вы же не отражаете в декларации оплаты. Вы показываете, сколько должно быть авансовых платежей и налога в результате вашей работы в 2018 году. Если вы декларацию откроете, то увидите, что там каждая строка четко расписана, где и что надо складывать и вычитать, ошибиться очень сложно. Переплата ваша будет висеть на том же КБК и по тому же ОКТМО, и автоматически перекроете ее при уплате авансовых платежей в 2018 году. При этом вам даже не нужно писать заявление с просьбой зачесть образовавшуюся сумму переплаты в счет будущих платежей по тому же налогу. А если будете возврат делать, то на комиссии банка потеряете. Да и вот-вот уже скоро новые авансы платить. Но, все же, сверку с налоговой сделать не забудьте, дабы избежать расхождений.