Подождите дня 3. Информация в личном кабинете появляется не сразу. Если ничего не изменится, идите в налоговую со своим экземпляром уведомления о переходе на УСН или с описью представленных документов.
В ИФНС сейчас проблемы с проблемы с программным обеспечением, много чего бесследно исчезает. А личный кабинет вообще живет своей жизнью.
Кассу вы зарегистрировать можете. Подтверждение подачи уведомления о переходе на упрощенку у вас есть, бардак в налоговой не может помешать вам применять спецрежим.