ИП безвестно отсутствует почти 5 лет. Налоговая подала в суд, хочет взыскать налоги за весь этот...

Если через суд человек не признан безвестнооотсуствующим, то нужно сделать это. И:

"
1. Обязанность по уплате налогов и сборов физического лица, признанного судом безвестно отсутствующим, исполняется лицом, уполномоченным органом опеки и попечительства управлять имуществом безвестно отсутствующего. Лицо, уполномоченное органом опеки и попечительства управлять имуществом безвестно отсутствующего, обязано уплатить всю неуплаченную налогоплательщиком (плательщиком сбора) сумму налогов и сборов, а также причитающиеся на день признания лица безвестно отсутствующим пени и штрафы. Указанные суммы уплачиваются за счет денежных средств физического лица, признанного безвестно отсутствующим." - ст. 51 НК РФ"

То есть налоги дожны были быть оплачены в день признаня ИП безвестноотсуствующим.