Про разделение вычета при продаже – 500 тыс – не согласна, т к у продавцов не общедолевая...

В вопросе 2) "Наташа продала 1/2 долю в доме (вторая часть дома в собственности у сестры) и сестра продала, в одном договоре продажи за 3 млн. весь дом." вы пишете именно доли, почему же тогда у продавцов не общедолевая собственность? 

Почитайте, пожалуйста, Письмо Минфина от 05.06.2019 № 03-04-05/41146

Согласно подпункту 3 пункта 2 статьи 220 Кодекса при реализации имущества, находящегося в общей долевой либо общей совместной собственности, соответствующий размер имущественного налогового вычета распределяется между совладельцами этого имущества пропорционально их долям либо по договоренности между ними (в случае реализации имущества, находящегося в общей совместной собственности).
Таким образом, в случае если предметом договора купли-продажи является квартира, находящаяся в общей долевой собственности нескольких лиц, сумма имущественного налогового вычета, установленная подпунктом 1 пункта 2 статьи 220 Кодекса, распределяется между всеми совладельцами этого имущества пропорционально их долям в праве собственности на указанную квартиру.