На мой взгляд, вы хотите перемудрить самого себя.
Если вы не укажете свои расходы и свое вознаграждение в отчете агента, то что вы там укажете? Если вы хотите указать только сумму, полученную от принципала, то как вам и советуют, переходите на УСН Д-Р, выдавайте акт на сумму, полученную от принципала, - это будет ваш доход, и учитывайте расходы на нанятую вами экспедиторскую компанию. Но, как вы верно заметили, вы получите налог в размере 15% от 300$.
В отчете агента надо указать ваши расходы (1200$ и ваше агентское вознаграждение 300$). И опять вы верно рассуждаете, в этом случае вашим налогооблагаемым доходом будет 300$, с которого вы заплатите 6%.