1. Получение патента не освобождает вас от ведения КУДиР. Если вы это делаете - там будет видно, что за доходы на самом деле вы получили. Кроме того, у большинства ИП на патенте сохраняется обязанность пробивать чеки на ККТ при расчетах с физлицами. Это все налоговая может проверить. При необходимости запросить дополнительные документы и информацию. Как у вас, так и у контрагентов (например, если они указаны в документах).
2. Указание ОКВЭД грузоперевозок, если по факту вы сдали авто в аренду, к примеру, - от штрафов вас не спасет :) Смотреть налоговики будут на факт, а не на ОКВЭД. Единственное, что можно посоветовать - проанализировать свою деятельность и, если понимаете, что будет и то, и другое - получить несколько патентов. На каждый вид. Это допускается.