Здравствуйте, все недоимки и пени платить надо все равно вне зависимости от перехода на ЕНП, иначе их просто снимут по решению налоговой.
Если Вы регулярно платите налоги в положенные сроки - в карточке расчётов с бюджетом налоги начисленные отразятся после сдачи отчёта РСВ и 6-НДФЛ.
Я поняла, что 2023 год сделали переходным именно из-за того, чтобы в карточках отразить начисления, сверить их с уплатами, рассчитать соответствие между начислениями и уплатами налогов и взносов, и уже затем принимать решения о распределении платежей
Это мои размышления