Знаючтоговорю, большое спасибо за комментарии. Совсем запуталась с этим НДФЛ...
Оплата физику была один раз. В КУДИР автоматом попала сумма 20000, когда была оказана услуга, и 2988 НДФЛ занесла вручную через записи КУДИР. Всего 22988. Верно?
Вроде такая же сумма, как вы говорите. Оплата и удержание НДФЛ в КУДИР не попадает.
В основном зарплата начисляется и выплачивается работникам в общем порядке и включается в расходы как оплата труда.