Еще раз перечитала всю тему. Вы пишите: "Но сам предприниматель вел там розничную торговлю на патенте до продажи недвижимости."
ВСЕ! Ваш доход должен облагаться налогом УСН. И не важно, что розничная торговля велась на патенте. Патент - та же предпринимательская деятельность, и врял ди вы сможете доказать обратное. Тем более, если в патенте был прописан адрес этого помещения.