Я считаю, что если ваше ИП на ОСНО или УСН то вы должны выдать чек при получении денег от физического лица. На патенте можно чек не давать при выдаче БСО (п. 2.1. ст. 2 закона 54 фз).
Исключение, когда ИП платит ИП с расчетного счета на расчетный счет. В данном случае нет речи о приеме налички. Это безнал и онлайн кассу можно не применять.
Если ИП уже оплатил с карты физика, то можно вернуть деньги ему и пусть оплатит заново с расчетного счета ИП.