Здравствуйте.
Платили прямо с рублёвого счёта? Контракт, наверное, всё-таки, не в рублях, а в условных единицах (полагаю). Инвойс долларовый по идее должен быть (на его основании ставится стоимость товара в ДТ)
Вот только таможня ставит свой курс, поэтому рублевый эквивалент стоимости товара будет больше, чем пересчитанный по курсу ЦБ. Это - таможенная стоимость, от которой считают НДС и пошлины.
У Вас должен быть инвойс в долларах, чтобы сравнить с ДТ, и оприходовать по долларовой стоимости товар.
Само собой, возникнет курсовая разница