После окончания налогового периода (это Ваш случай) для внесения исправлений необходимо заполнить дополнительный лист книги продаж за тот квартал, в котором зарегистрирован ошибочный счет-фактура (абз. 3 п. 3 Правил ведения книги продаж, утв. Постановлением № 1137). В дополнительном листе аннулируется неверный счет-фактура и вписываются данные исправленного счета-фактуры (п. 3 Правил заполнения дополнительного листа книги продаж, утв. Постановлением № 1137).
Исправление ошибки, связанной с занижением суммы реализации, в учетной системе регистрируется документом Корректировка реализации с видом операции Исправление в первичных документах. По кнопке Выписать исправленный счет-фактуру регистрируется исправленный счет-фактура.
Вы делали так же?