Каков порядок налогообложения расходов на провоз багажа в командировке?

Зависит от суммы обстоятельств. Что это был за багаж? Кто взимал плату за провоз?
К примеру, если сотрудник вез в багаже какие-нибудь образцы, нужные для презентации и заключения контракта и с него взяли дополнительный сбор за перевес багажа - это будет один вариант.
А если сотрудник личные вещи вез, чтобы потом провести отпуск в месте командировки - это уже немного другое :)

Татьяна Симонова, я не поняла о каком налогообложении расходов на провоз багажа Вы пишите?
Если работник направлен в неоднодневную командировку, то он поедет с багажом. Директор даже в однодневную летает с багажом - костюм, обувь, документы и т.д. и т.п.
Для того, чтобы спокойно брать определенные расходы на командировки в затраты в целях налога на прибыль, мы разработали положение о командировочных расходах, в котором прописали, что если командировка до 3х дней, то расходы на багаж не положены. В исключительных случаях - по согласованию с руководством. Из филиала, например, коробку первички передают или запчасти везут, то берем в расходы. А если из Тывы орехи везут и вяленое мясо и рыбу - то за свой счет. 

В случае направления работника в служебную командировку работодатель обязан возмещать ему, в частности, расходы на проезд, а также иные расходы, произведенные работником с разрешения или ведома работодателя.
Возмещение иных расходов, связанных с командировками, осуществляется при представлении документов, подтверждающих эти расходы.
Работник по возвращении из командировки обязан представить работодателю в течение трех рабочих дней авансовый отчет об израсходованных в связи с командировкой суммах вместе с документами, подтверждающими фактические расходы на проезд и иные расходы, связанные с командировкой.

НДФЛ
Компенсационные выплаты, установленные законодательством РФ (включая возмещение командировочных расходов), не подлежат налогообложению НДФЛ. При оплате работодателем налогоплательщику расходов на командировки как внутри страны, так и за ее пределы в доход, подлежащий налогообложению, не включаются произведенные и документально подтвержденные целевые расходы на проезд до места назначения и обратно, расходы на проезд в аэропорт или на вокзал в местах отправления, назначения или пересадок, на провоз багажа.
Таким образом, компенсация работнику расходов на провоз багажа в командировке не облагается НДФЛ при условии документального подтверждения.

Страховые взносы
Не облагаются страховыми взносами установленные законодательством компенсационные выплаты, связанные с выполнением трудовых обязанностей. При оплате расходов на командировки работников не подлежат обложению страховыми взносами суточные, предусмотренные п. 3 ст. 217 НК РФ, а также фактически произведенные и документально подтвержденные целевые расходы на проезд до места назначения и обратно, сборы за услуги аэропортов, комиссионные сборы, расходы на проезд в аэропорт или на вокзал в местах отправления, назначения или пересадок, на провоз багажа.

Налог на прибыль организаций
К прочим расходам, связанным с производством и реализацией, относятся расходы на командировки.
Перечень командировочных расходов является открытым (пп. 12 п. 1 ст. 264 НК РФ).
Поскольку рассматриваемые затраты на оплату провоза багажа непосредственно связаны с проездом к месту служебной командировки и обратно, они соответствуют критериям п. 1 ст. 252 НК РФ и могут быть учтены в составе расходов по налогу на прибыль.