В части учета сложностей нет. Основной расход - зарплата сотрудника, который стоит на входе и проверяет коды. Тут без вопросов, куда эту зарплату относить.
Если вам придется приобрести смартфон с функциями для проверки - тоже не вижу особых проблем с отнесением на расходы. Ведь так вы исполняете обязательные требования.