Виктория9621, добрый день.
Если в договоре аренды прописывается 60 000 руб, в т.ч. НДС 20%, то 60 000 руб - это вся сумма, которую заплатит ИП.
Если 60 000 рублей + НДС (сверху), то расходы на аренду составят 72 000 руб (60 000 + 20% НДС).
В обоих случаях арендодатель обязан выставить счёт-фактуру на сумму НДС (в т.ч. или сверху), а ИП обязан эту сумму уплатить.
К сожалению, при УСН, 6%, вы не сможете принять эти расходы к вычету.