Elena2507, думаю, что переплата висит именно за 2017 год, когда вы получали вычет. Я чуть выше ответила Оксане87 на подобный вопрос с примером. Думаю, вы разберетесь. Почитайте.
Когда будете подавать декларацию за 2019 год, вам придется указывать корректировку 1, по другому система вряд ли примет ее. Но не волнуйтесь, никаких выплат вам не было положено, ваша новая декларация сотрет ТУ совсем, и работать будут только с новыми данными.
Что касается полученных средств и долга за 2017 год, то тут или придется искать ваш экземпляр декларации, или обращаться за копией в налоговую. Других способов доказать, что вы имели право на вычет и получили его законно, я не вижу.
То есть, нужно будет подать уточненную декларацию за 2017 год с теми данными, которые вы заявляли первоначально. Те, по которым получали вычет! Единственное отличие от той декларации - номер корректировки тут появится.