Мне кажется, что оплатить лучше одним платежом с указанием 3 квартала, а по окончании года «потянуть» сдачу отчета по УСН до последних дней. Почему? Чтобы минимизировать риск получения неприятностей.
Ведь в налоговой программе учет начисления или уменьшения налога по итогам года производится лишь 31 марта для ООО и 30 апреля для ИП — по сроку уплаты налога за год. И если вы сдадите свой отчет близко к указанным датам, программа может просто «не успеть» проверить ваши авансы.
Если уже сегодня произвести оплату с указанием «за 1 квартал», то пени однозначно будут. Ведь вы сами их себе назначите.
Но, посмотрим что напишут более компетентные коллеги.