Добрый день.
Из вашего вопроса непонятно, что было не так в сч.ф. поставщика. Но в любом случае, за уточнение деклараций санкции не предусмотрены. Если в результате исправлений у вас увеличился налог к уплате и образовалась недоимка, будут пени. Если налог не изменился, никаких последствй не будет. Если налог к уплате уменьшился, санкций не будет, но во время КНП могут запросить пояснения причины уменьшения налога.