Добрый день.
Если обе организации коммерческие, передать товар безвозмездно вы не можете, сами же написали, что ГК запрещает. Сделка будет недействительной.
Фразу про прибыль, я тоже не поняла. Безвозмездная передача облагается НДС. Как следствие, входной НДС можно принять к вычету.
В части налога на прибыль все верно. Учесть при расчете налога на прибыль покупную стоимость товара вы не сможете. Одаряемый учтет полученное при налогообложении своей прибыли.