Добрый день.
В учетном политике организация определяет способы учета в тех случаях, когда есть выбор. Жестко установленные законом нормы изменить учетной политикой нельзя. Т.е., учетной политикой нельзя изменить ни стоимость, свыше которой объекты учитываются в составе основных средств в БУ, ни стоимость, свыше которой объекты учитываются в составе амортизируемого имущества в НУ.
Если вы объект стоимостью от 40 до 100 тыс.руб. учетете в НУ в составе амортизируемого имущества, то в периоде принятия объекта к учету расходы для налога на прибыль будут занижены, налогооблагамая база - завышена. Покарать вас за это нельзя. Но списание амортизации в последующих периодах приведет к завышению расходов и, соотвественно, к занижению налогооблагаемой базы, что является налоговым нарушением.