Да, Perito прав: если НДС нельзя взять к вычету именно по причине того, что приобретаемые товары, работы, услуги не будут использованы в деятельности, облагаемой НДС, сумма налога включается в стоимость приобретённых товаров, работ, услуг.
Меня смущает, что это НДС налогового агента, который привязан к курсу валюты расчетов на момент оплаты.
Допустим, работы стоят 1200 у.е. Мы включаем в себестоимость товара (линии) всю сумму целиком. В день оплаты за работы 200 у.е. удерживаем по курсу на этот день и перечисляем в бюджет. Нам все равно рублевый эквивалент, просто больше или меньше удержим и заплатим? Как-то до этого в рассуждениях я момент этот упустила.