В данный момент наша организация  осуществляет ремонт некоторых помещений в нежилом здании, которое...

Добрый вечер! Учитывая пункт 3 ст. 256 НК РФ, амортизируемым имуществом не может признаваться имущество, переведенное по решению руководства на консервацию на срок от трех месяцев. В случае, если Вы в налоговом учете выделите два объекта основных средств: первый объект - часть здания на консервации и второй - часть здания, используемая в предпринимательских целях, присвоив при этом каждому из объектов инвентарные номера, то Вы можете продолжить начислять амортизацию по части здания, в силу норм ст. 252 НК РФ, которую будет отражать в расходах в целях исчисления налога на прибыль. В ситуации, когда в налоговом учете здание невозможно поделить на два инвентарных номера с учетом использования в деятельности, то амортизацию по зданию начислять невозможно с месяца, следующего с даты приказа о консервации до ее окончания (посмотрите Письмо Минфина России от 19.10.2012 № 03-03-06/1/560).