ДДС то по идее может и автоматом формироваться, если к примеру будет реализована возможность указывать статью затрат при совершении казначейской операции по списанию или поступлению денежных средств.
Согласен полностью с Сергеем, тут надо спецов по 1Ске подключать, чтобы они допиливали программу. Ну и потом можно сказать директору, что если хочет видеть все детально и в разрезе, то пусть готовится к финансовым затратам на ПО.