Как правильно разработать номенклатуру дел?

Вопрос довольно объемный и единого подхода нет. Для начала нужно изучить:
• Правилами организации хранения, комплектования, учета и использования документов Архивного фонда РФ и других архивных документов в органах государственной власти, органах местного самоуправления и организациях утвержденные Приказом Минкультуры России от 31.03.2015 N 526;
• Методическими рекомендациями по применению Правил организации хранения, комплектования, учета и использования документов Архивного фонда РФ и других архивных документов в государственных органах, органах местного самоуправления и организациях
• Перечнем типовых управленческих архивных документов, образующихся в процессе деятельности государственных органов, органов местного самоуправления и организаций, с указанием сроков хранения Утвержденные Приказом Минкультуры России от 25.08.2010 N 558.
https://nalog-nalog.ru/spravochnaya_informaciya/kak_sostavit_nomenklaturu_del_v_organizacii/ - а вот тут как раз ответ на ваш общий вопрос.