Добрый день!
Если ваша организация находится на УСН, то вы работаете без НДС. Совмещать УСН и ОСНО нельзя. Совмещать ЕНВД и ОСНО по одному виду деятельности тоже нельзя.
Можно, конечно, находясь на УСН, выставить счет-фактуру ну уж очень хорошему клиенту, который это просит, отчитаться по НДС и уплатить его в бюджет. Но делать это постоянно – неразумно. Если у вас предполагаются клиенты, которым нужен ваш НДС и которым этот НДС не нужен, и вы хотите угнаться за всеми, то есть смысл открывать две фирмы на разных системах налогообложения. В этом случае, конечно, неплохо бы просчитать математически ваши выгоды.
Из вашей другой ветки: грузовладельцы – это ваши клиенты. А перевозчики вы имеете в виду – исполнители? Ваша система налогообложения влияет только на ваших клиентов. Ваши поставщики работают по своей системе налогообложения. Если они на УСН, то без НДС выставляют вам свои услуги. Если на ОСНО, то с НДС. Если, конечно, я верно вас поняла.