Добрый день!
Я проверяю, просто просматривая каждый счет. Какие остатки у меня по субсчетам, соответствуют ли они логике и действительности. По задолженностям контрагентов, как кредиторка, так и дебиторка, если требуется, запрашиваю сверки.
У вас учет ведется автоматизировано? В этом случае совсем уж косяков с обороткой быть не должно, если вы не вносите много операций вручную.
В конце месяца должны быть закрыты (в общем случа) затратные счета: 25, 26,44 - это из основных. 20 счет может быть закрыт. Если есть незавершенка, то может иметь сальдо.
Далее закрыты должны быть 90 и 91 счет.