А за какой период переплата? Пенсионные взносы, как я понимаю? Или вообще всё на не те КБК? Если за период до 2017 года, то это в пенсионный надо обращаться.
Если вся эта история уже после перехода в налоговую случилась, и налоговая в курсе, раз переносили на верные КБК, то пишите заявление. 3 года еще не прошло. Должны вернуть.