Добрый день!
Для точного ответа маловато информации: за какой месяц эта зарплата, была ли выплата аванса. Уточните эту информацию, а пока можно лишь предположить следующее.
Предположим, что это зарплата за апрель, и аванса никакого не было. Тогда так:
31.04.2019 300 000
14.05.2019 39 000 (допустим, никаких вычетов нет)
15.05.2019
31.04.2019 400 000
15.05.2019 52 000
16.05.2019
Если предположить, что в апреле был выплачен еще аванс, тогда надо сделать так:
31.04.2019 сумма аванса + 300 000
14.05.2019 13% от (сумма аванса + 300 000)
15.05.2019
31.04.2019 400 000
15.05.2019 52 000
16.05.2019
То есть сумму надо разделить, так как НФДЛ следует удержать при выплате фактически полученного дохода. Апрельская зарплата фактически получена 31.04.2019. Выплачиваем в мае в любой разбивке – каждый раз удерживаем и перечисляем НДФЛ с фактически выплаченной суммы. Тот факт, что вы перечислили НДФЛ 15 мая, в расчете 6-НДФЛ не отражается.
Но повторюсь, уточните, за какой месяц зарплата. Если она вообще майская, то цифры будут другие.