Веду ИП на ОСНО без работников. Купили товар на 50000 руб. Нам дали кассовый чек на 50000 руб, с\ф...

В вашем случае погрузосно-разгрузчные работы по факту увелилисли стоимость приобретения материалов, поэтосму нужн овключать в материальные затрты.В вашем случае расходы определяются по правилам, действующим для расходов по налогу на прибыль.
Тогда:
СТ. 254 НК РФ Материальные роасходы:

"К работам (услугам) производственного характера также относятся транспортные услуги сторонних организаций (включая индивидуальных предпринимателей) и (или) структурных подразделений самого налогоплательщика по перевозкам грузов внутри организации, в частности перемещение сырья (материалов), инструментов, деталей, заготовок, других видов грузов с базисного (центрального) склада в цеха (отделения) и доставка готовой продукции в соответствии с условиями договоров (контрактов)"
Следовательно можете смело относить к материальным расходам.