Нда.. Не самая простая ситуация. Есть пара способов решения, но они будут сопряжены с определенными трудностями. И ссылки на законодательство, конечно, не будет. Т.к. законодательно вам надо бы ставить весь этот НДС во 2-м квартале в вычет и нарываться на налоговую проверку (как я понимаю - долг бюджета перед вами образуется).
Самый простой способ - указать в с/ф нужную вам дату получения (2-й, 3-й, 4-й квартал соответственно). И поквартально ставить к вычету НДС по каждому. Этот способ желательно согласовать с поставщиком (у него может стоять весь НДС с реализации во 2 квартале и тогда ваша "хитрость" может всплыть при какой-нибудь встречной проверке).
Возможности рассрочить вычет НДС по одному с/ф на несколько периодов точно нет.