Добрый день!!!
Какой статус юридически значим? Только ГИС ЭПД. Электронный перевозочный документ в ГИС ЭПД — это законный первичный документ (ст. 9 ФЗ № 402-ФЗ). ГосЛог — это реестр участников, статус там технический, для учёта не применяется. ГИС ЭПД и ГосЛог — разные системы, верить нужно ГИС ЭПД.
Будет ли нарушением закрытие по ГосЛог? Да, риск есть. ФНС проверяет данные ГИС ЭПД. Если отразите расход раньше, чем в ГИС ЭПД появится «Доставка завершена», могут доначислить налоги и штрафы. Не закрывайте месяц, пока ГИС ЭПД не подтвердит доставку.
Что делать сейчас? Свяжитесь с перевозчиком — возможно, грузоотправитель или грузополучатель не подписали титулы в ЭДО. Дождитесь финального статуса в ГИС ЭПД и только тогда проводите операцию в 1С. Данные ГосЛог для учета не используйте.
Как стыковать в учётной политике? Закрепите приоритет ГИС ЭПД над ГосЛог. Пропишите ежемесячную сверку статусов между системами и фиксацию расхождений — это создаст доказательную базу для ФНС.