Если счет-фактура аннулируется до окончания того квартала, в котором попал в книгу покупок, аннулирующая запись делается в самой книге. При этом показатели в графах 14-15 указываются с отрицательным значением, а в остальных строках повторяются оставшиеся данные ошибочного счета-фактуры. Следом регистрируется исправленный счет-фактура, если аннулирование связано с ошибкой.
Если аннулировать документ надо уже по окончании квартала, «минусующая» запись производится в доплисте книги покупок за тот период, в котором счет-фактура был зарегистрирован. При этом не важно аннулируется он из-за внесения в него исправлений или по иным причинам.
Об этом — в п. 9 Правил ведения книги покупок (см. также письмо Минфина от 26.12.2016 № 03-07-09/77996).
Аналогичный принцип действует и для книги продаж.
Образец заполнения доплиста книги покупок по новой форме с 3 квартала 2021 года при аннулировании счета-фактуры смотрите в КонсультантПлюс, бесплатно оформив пробный доступ к системе:
Подробнее об аннулировании счетов-фактур читайте в статье «Как правильно аннулировать счет-фактуру?».
Добавим, что аннулирование счета-фактуры в книге покупок уменьшает вычет НДС. А значит, требует подачи уточненки. Как ее составить узнайте из этой статьи.