При выплате отпускных вычеты по НДФЛ предоставляются в общем порядке. На это указывал Минфин (письма от 28.01.2021 № 03-04-05/5316, от 15.11.2011 № 03-04-06/8-306).
Дата фактического получения дохода в виде отпускных — день выплаты. В этот же день нужно рассчитать и удержать с них НДФЛ. Если у работника есть право на вычет, налог рассчитывается с учетом вычета.
При расчете НДФЛ с зарплаты по итогам месяца нужно учитывать, что вычет за этот месяц работнику уже предоставлен.
Пример расчета НДФЛ при переходящем отпуске с учетом применения вычетов смотрите в готовом решении от «КонсультантПлюс». Пробный доступ к системе бесплатный.