Единый реестр формирует ФНС на основании сведений, подаваемых организациями и ИП в составе налоговой отчетности (ст. 4.1 Закона № 209-ФЗ). Далее цитата из этой же статьи:
"4.1. Внесение сведений о юридических лицах и об индивидуальных предпринимателях в единый реестр субъектов малого и среднего предпринимательства и исключение таких сведений из указанного реестра осуществляются уполномоченным органом с 10 января по 10 июня текущего календарного года в порядке, установленном частью 5 настоящей статьи"
Но для Вас должен дейсвовать порядок из пп.2 п.5 ст. 4.1 Закона № 209-ФЗ:
"Сведения о вновь созданных юридических лицах и вновь зарегистрированных индивидуальных предпринимателях, отвечающих условиям отнесения к субъектам малого и среднего предпринимательства, установленным ч. 3 ст. 4 настоящего Федерального закона, вносятся в единый реестр субъектов малого и среднего предпринимательства 10-го числа месяца, следующего за месяцем внесения соответственно в единый государственный реестр юридических лиц, единый государственный реестр индивидуальных предпринимателей сведений о создании юридического лица, государственной регистрации физического лица в качестве индивидуального предпринимателя"
Таким бразом, сведения о Вас в реестр МСП должны бвли внести в срок до 10.12.2020 года. Возможно у Вы на тот момент по какому-то критерию для малых предприятий не подходили.