Транспортная компания (ООО на ОСНО) является перевозчиком грузов из России в Казахстан и наоборот, как должен уплачивать налог. Есть ли сложности?

Добрый день! ООО Транспортная компания (ж/д перевозки грузов), организация на ОСНО, будет перевозить грузы из России в Казахстан и наоборот. Какие риски в начислении НДС для Российской компании?

В соответствии с НК РФ ставка НДС в размере 0% применяется в отношении транспортно-экспедиционных услуг при перевозке товаров между пунктами, один из которых находится на территории Российской Федерации, а другой - на территории иностранного государства. Если оба пункта находятся на территории России, такие услуги подлежат налогообложению по ставке 20%

По поводу сложностей:

В целях применения нулевой ставки НДС Вам надо будет представить в ИФНС контракт с иностранным или российским лицом на оказание указанных услуг.
Контракты с иностранными контрагентами могут быть представлены в ИФНС в виде составленного в письменной форме одного документа, подписанного сторонами, либо документов, свидетельствующих о достижении согласия по всем существенным условиям сделки.

Такие документы должны содержать необходимую информацию о предмете, участниках и условиях сделки, в том числе о цене и сроках ее исполнения. Вместе с контрактом организация представляет копии транспортных, товаросопроводительных и иных документов, подтверждающих вывоз товаров за пределы территории РФ.

Если погрузка товаров и их таможенное оформление осуществляются вне региона деятельности российского таможенного органа места убытия, в налоговые органы представляется копия поручения на отгрузку товаров с отметкой российского таможенного органа, подтверждающей вывоз товаров за пределы территории РФ.

Срок подачи документтов для подтверждения ставки 0% - 180 дней после подачи декларации 

Но не рекомендую задерживать, лучше иметь на руках готовый комплект заранее