насчитали задолженность по НДС

Добрый день. Юр лицо в апреле 2023 года подало заявление по ст 145 НК РФ "об освобождении по НДС". Бухгалтер, в силу перехода на законы РФ и прочую занятость, не внимательно прочла условия ст. 145. Она считала не три предыдущие месяцы, а поквартально 2 млн. Теперь получается, что нужно доначислить НДС за 2023 год в размере 1 млн 300 тыс. Как быть в данной в ситуации. Юр лицо работает по выполнению гос заказа, доходов от комерческой деятельности нет 

можно ли применить какие послабляющие нормы, в связи с тем что предприятие находится на територии ДНР? 

предприятие находится в стадии реорганизации, путем присоединения к другому юр лицу.

мы согласны с тем, что сумма НДС доначислена правильно. можем ли мы доначисленную сумму включить в фактическую калькуляцию, т.к. эти расходы будут текущими и предьявить ее тому-же покупателю, в нашем случае министерство за выполнение гос заказа. калькуляцию состоит из з/пл и отчислений. других доходов предприятие не имеет.