Добрый день!
П. 9 ст.172 НК РФ говорит о том, что вычеты сумм налога, указанные в п. 12 ст. 171 НК РФ, производятся на основании счетов-фактур, выставленных продавцами при получении оплаты, частичной оплаты в счет предстоящих поставок товаров.
П. 12 ст. 171 НК РФ говорит о вычете у налогоплательщика, перечислившего суммы оплаты, частичной оплаты в счет предстоящих поставок товара.
То есть для принятия к вычету должно быть основание – счет-фактура от продавца. В 3 квартале, то есть на 30.09.2019 у вас оснований для вычета нет, так как нет счет-фактуры.
На мой взгляд, вы не можете принять к вычету эту сумму в 3 квартале.