Максим85, здравствуйте. Очень сложный случай у вас. И есть на этот счет взаимоискючающие позиции.
Я вижу, что вы понимаете, что минимальный срок владения считается с момента получения вами нового кадастрового номера квартиры, т.к в результате объединения появляется новый объект права собственности.
Но существует и иная точка зрения в отношении налогообложения доходов, полученных от продажи объединенной квартиры. Так, Президиум Нижегородского областного суда в постановлении от 17.08.2011 по делу № 44-г-86/11 указал, что объединение двух квартир в одну является перепланировкой этих квартир. Действующее законодательство не предусматривает в качестве основания прекращения права собственности на недвижимость ее перепланировку. Из пунктов 26, 27, 36 Правил ведения Единого государственного реестра прав на недвижимое имущество и сделок с ним, утвержденных постановлением Правительства РФ от 18.02.98 № 219, следует, что в случае слияния ранее существовавших объектов закрывается связанный с ними раздел указанного реестра, поскольку прекращает существование объект недвижимости как единица кадастрового учета. Но право собственности на имущество, которое до слияния объекта недвижимости находилось у гражданина в собственности в виде двух объектов недвижимости, не прекращается. Такие обстоятельства, как изменение объекта недвижимого имущества в связи с реконструкцией или перепланировкой (переустройством) без изменения внешних границ, не влекут за собой прекращения или перехода права на него. Поэтому факт регистрации объединенной квартиры не влечет прекращения права собственности на квартиры, из которых она составлена.
К сожалению, более позднего решения суда я не нашла, но прецедент есть, чтобы вообще не оплачивать НДФЛ с продажи, пройдя круги ада судов.
Есть на эту тему письмо Департамента налоговой и таможенной политики Минфина России от 19 июля 2016 г. № 03-04-05/42227, где говорится что начало владения квартирой следует отсчитывать с момента первоначальной государственной регистрации права собственности на квартиру, которая претерпела перепланировку, – а не с даты повторного получения права собственности на нее.
Статья 235 ГК РФ предусматривает основания прекращения права собственности: отчуждение собственником своего имущества другим лицам, отказ собственника от права собственности, гибель или уничтожение имущества, утрата права собственности на имущество в иных случаях, предусмотренных законом. Изменение объекта недвижимого имущества в связи с реконструкцией или перепланировкой без изменения внешних границ не влечет за собой прекращения или перехода права на него.
Таким образом, факт внесения налогоплательщиком изменений в ЕГРН в связи с увеличением площади квартиры в результате перепланировки без изменения внешних границ не влечет прекращения права собственности налогоплательщика на данную квартиру.
В связи с этим моментом возникновения права собственности у налогоплательщика является не дата внесения изменений в ЕГРН в связи с осуществлением перепланировки, а момент первоначальной государственной регистрации права собственности.
Учитывая изложенное, поскольку квартира принадлежала налогоплательщику (независимо от изменения жилой площади квартиры в результате осуществления ее перепланировки без изменения внешних границ квартиры) более минимального предельного срока владения, то его доходы от продажи данной квартиры не будут подлежать обложению налогом на доходы физических лиц.
Данная позиция согласована с Министерством финансов Российской Федерации.
Если вам удастся настоять на этой позиции, то отсчет минимального срока владения квартирой начнется для вас с 2014 года.