Добрый день!
Не поняла, что вы имели в виду под "а 2/3 стоимости патента в сумме 25721 руб. было подано в налоговую заявление о зачете". Что вы подали? Уведомление об уменьшении патента? Заявление на зачет ЕНП в счет уплаты взносов?
ИП совмещает две системы налогообложения, поэтому фиксированные взносы ИП за себя для учета в обеих системах налогооблоожения следует делить пропорционально полученным доходам. Для уменьшения патента уплачивать взносы не обязательно. Для учета взносов при расчете налога УСН доходы минус расходы, взносы должны быть уплачены.
В отношении патента вам надо подать уведомление об уменьшении патента (всей суммы патента) на сумму взносов, относящихся к патенту. Если при этом получится, что вы переплатили патент (когда платили 1/3), то переплата вернется вам на ЕНС.
В отношении учета взносов в расходах при УСН вы взносы должны уплатить. Что вы и сделали. Так что часть взносов, которая относится к УСН, можно учесть в расходах при расчете налога при УСН за год. Взносы за 2023 года будут считаться уплаченными 9 января 2024 года, когда их по сроку уплаты спишут с ЕНС. Чтобы они считались уплаченными в 2023 году, я бы советовала подать заявление на зачет необходимой суммы. Если вы платили взносы со статусом 02, и они у вас легли в отложенные платежи, а не в сальдо ЕНС, то заявление можно не подавать.