vitosio, а вопрос-то в чем ?
Совершенно очевидно, что результат расчетов (например, НДС, если считается расчетным путем),
будет зависеть от кол-ва знаков после запятой в параметрах расчетов.
Это - математика, а не влияние МФ или кого-то другого.
Соответственно, ошибки округления зависят от ПО, которое считает суммы. И другого не будет.
При сложении многих промежуточных результатов со своими ошибками, абс. значение ошибки может расти.
Если Ввам это не нравится, Вы можете изменить либо математику, либо ПО ЭТП. Второе - легче (IMHO).