Марина, а можно у вас оплачиваемуюконсультацию по телефону получить?

Если смотреть абзац, на который они ссылаются в требовании (абз. 2 п. 3 ст. 88 НК РФ), то в нем четко указано что при камералке уточненной декларации по налогу на прибыль, где заявлена сумма к уплате меньше по сравнению с первоначальной декларацией, налоговики могут затребовать пояснения, обосновывающие изменение показателей.

Также читаем п. 7 ст. 88 НК РФ, где четко сказано, что требовать дополнительные сведения и документы налоговики не имеют права, если это прямо не предусмотрено ст. 88 НК РФ. Документы при уменьшении налога к уплате в уточненке по налогу на прибыль могут требовать только если такая уточненка подана по истечении 2 лет с даты, когда декларация должна была быть представлена (п. 8.3 ст. 88 НК РФ). 

Предоставить документы - это право, а не обязанность налогоплательщика (п. 4 ст. 88 НК РФ). 

Исходя из этого, в ответ на требование пишем, что согласно абз. 2 п. 3 ст. 88 НК РФ представляем пояснения. И далее описываем, что была совершена техническая ошибка и строки 210-230 в первичных декларациях за 9 месяцев и за год не были заполнены. 

Про распределение по обособкам ничего пока сказать не могу, так как никакой информации вы не дали. Там тоже какие-то вопросы? 

Вы мне можете написать на почту marina.sivof@yandex.ru.