Ответы с отказами обычно шлют на адрес регистрации ИП.
Подайте жалобу , нарушение срока не являтся основанием для отказа. Есть положительная практика 
. Вас попросят отозвать жалобу, а вы настоятельно получите сначала патент по вашему сроку 1 июля, а затем отзывайте.
ЭЦП для ИП советую.
В электронном виде всё увидите.