Вобщем, почитала про ученический договор. Сергей экономист прав по поводу, что если Вы понесли затраты на 100₽, вернуть должны Вам все 100. Студент оказался хитрым, посчитал, что с ним несправедливо поступили и возвращать в кассу должен был только то, что ему перечисляли, заявил возврат, а Вы не отказали и вернули
И теперь у Вас уже не излишне удержанный налог, а невозможный взысканию (если Вы не будете больше выплачивать ему доход), и справочку по нему должны подать с его долгом.
И если Вы такой налог не задекларируете как невозможный к взысканию, Вы его не вернёте. Нарисуйте себе схему удержания, задекламированного и фактически уплаченного
Могу потом нарисовать Вам