Исходя из правил заполнения раздела 2 справки 2-ндфл в составе формы 6-ндфл, сумма налога удержанная – та сумма, которую налоговый агент удержал при выплате дохода
Доход не выплачен - налог не удержан.
Налоговая проверяет контрольные соотношения заполнения 6-ндфл с суммами по сотрудникам в приложении.
Для этого и соединили оба отчета, чтобы понимать поквартально соблюдение сроков начисления, удержания и перечисления налога по каждому в отдельности.
Предыдущий отчёт содержал "свернутые" сведения в то время как сроки выплаты доходов и удержания налогов в развёрнутом виде по каждому сотруднику содержат более точные данные для контроля.
Это чем-то напоминает НДС, если Вы в курсе.