Корректировать реализацию в сторону уменьшения в «1С:Бухгалтерия» нужно аналогично корректировке поступления: выбираем операцию (это может быть как корректировка по согласованию, так и внесение необходимых исправлений в первичных документах) и вносим изменения в количество или стоимость реализованного товара в соответствующих столбцах в разрезе каждой позиции номенклатуры.
Вам надо было выбрать "исправление в первичных документах" и "отразить во всех разделах учета"
Да, в книгу покупок попадёт данная корректировка (Главбух Елена права)
Тогда БУ и НУ у Вас сойдутся