В 2013 году по наследству от родителей получила 1/3 долю в квартире, в 2021 году докупила 2/3 долей...

Из п. 17.1 ст. 217 НК РФ следует, что доходы от продажи недвижимого имущества (долей в нем), находившегося в собственности физического лица дольше установленного законодательством минимального срока, освобождаются от обложения НДФЛ. Минимальный срок владения составляет:

• При получении по наследству – 3 года (п.3 чт. 217.1 НК РФ);
• При покупке – 5 лет (п. 4 ст. 217.1 НК РФ).

Если квартира продается ранее этих сроков, максимальная сумма вычета 1 000 000 руб. или сумма затрат на приобретение (п. 2 ст. 220 НК РФ).

Судебной практики по данному вопросу нет. Но если опираться на разъяснения Минфина, то срок владения считается с момента получения первой доли (см. пример Письма Минфина России от 15.01.2021 N 03-04-05/1273, от 13.01.2015 N 03-04-05/69528, от 24.07.2013 N 03-04-05/29162, от 29.01.2021 N 03-04-05/5768). То есть формально НДФЛ с продажи Вам платить по мнению ведомства не нужно.

Но, нужно учитывать, что разъяснения Минфина силы закона не имеют и у каждого налогового инспектора, проверяющего Вашу декларацию, может быть свое мнение. Напишите официальный запрос в ту налоговую, где состоите на учете, сославшись на указанную позицию Минфина и сделайте так, как они Вам письменно ответят.

Судебной практики нет, потому что все выводы Минфина основаны на конкретных положениях гражданского кодекса. Поэтому налог скорее всего платить Вам не придется, а инспектор, который сказал, что Вам нужно будет это сделать, просто не вник в суть Вашего вопроса. Официальный запрос в налоговую по совету Сергея сделайте, более чем уверена, что они Вам ответят так же как и Минфин.

Спасибо большое Вам за такой скорый ответ! Благодарю